2 сезон «Хозяина» продолжает историю Егора Таранцева, который теперь работает в убойном отделе полиции. Он наконец-то обрёл семейное счастье, но спокойная жизнь длится недолго. В город возвращается женщина из его прошлого — Елена Шадрина, чьё появление становится катализатором череды трагических событий.
Массовое отравление сидром, новое криминальное руководство и внутренние разборки в полиции ставят Таранцева перед сложным выбором. Он вынужден действовать на грани закона, чтобы не только раскрыть преступление, но и не дать городу погрузиться в хаос. Любовный треугольник между ним, женой и Шадриной ещё больше осложняет ситуацию.