Во 2 сезоне Казачка сюжет принимает ещё более остросюжетный поворот. Вновь оказавшийся в прошлом Степан должен вызволить Марию, которую похитил Назар. Их путешествие разворачивается на фоне масштабных исторических перемен.
История переплетается с попытками сохранить ход событий, когда вмешательство из будущего может обернуться катастрофой. В настоящем времени тем временем появляется новый конфликт — оставшиеся казаки вынашивают опасный замысел, который может повлиять на символы государственной власти.
