В 4 сезоне детективного сериала «Первый отдел» полковник юстиции Юрий Брагин оказывается в центре служебного расследования. Его подозревают в попытке помочь своему другу, оперативнику Михаилу Шибанову, избежать ареста. В результате Брагин отстранён от службы, а Шибанов находится под стражей по обвинению в превышении должностных полномочий и участии в преступной группе, занимающейся транзитом наркотиков через Россию в Европу.
Параллельно в Астраханской области разворачивается история с исчезновением туриста Юрия Круглова. Молодой человек пропал при загадочных обстоятельствах, и его поиски переплетаются с судьбами главных героев. Сериал продолжает исследовать сложные моральные дилеммы и личные испытания, с которыми сталкиваются сотрудники правоохранительных органов в своей работе.