В новом сезоне «Первого отдела» полковник Юрий Брагин сталкивается с серьёзными обвинениями в попытке помочь своему другу Михаилу Шибанову избежать ареста. Брагин отстранён от службы, а Шибанов находится под арестом по подозрению в превышении полномочий и участии в наркоторговле. Ситуация осложняется служебной проверкой, результаты которой могут привести к уголовному преследованию Брагина.
Одновременно в Астраханской области происходит загадочное исчезновение туриста Юрия Круглова. Обстоятельства его пропажи вызывают множество вопросов и постепенно переплетаются с основным сюжетом сериала. Четвёртый сезон обещает быть насыщенным неожиданными поворотами и глубоким погружением в личные и профессиональные испытания главных героев.